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脉冲场凝胶电泳技术与常规的直流单向电场凝胶电泳不同，这项技术采用定时改变电场方向的交变电源，每次电流方向改变后持续1秒到5分钟左右，然后再改变电流方向，反复循环，所以称之为脉冲式交变电泳。
脉冲电泳分离大分子DNA的介质是琼脂糖，20kb—5000kb的线性双链DNA片段在琼脂糖凝胶的网孔中的泳动，就象蛇行式地寻找弯曲蜿蜓的孔隙。普通的单方向恒定电场给DNA分子的泳动动力其方向确定且不发生变化，所以严重影响凝胶电泳分离大分子量DNA 片段的效果。
脉冲电泳施加在凝胶上至少有两个电场方向，时间与电流大小也交替改变，使得DNA分子能够不断地调整泳动方向，以适应凝胶中不规则的孔隙变化，达到分离大分子线性DNA的目的，最大分辨率为5000kb大小的线性DNA分子。
脉冲电泳仪主要用于20kb—5000kb的大分子量DNA的研究，主要应用于以下几个方面：
l 基因组DNA的研究
l 细胞染色体核型的分析和研究
l 基因文库的构建
WD-2101A 脉冲场凝胶电泳系统简介
本脉冲电泳系统由4部分组成：
a.制冷器；b.脉冲电泳仪电源; c.制胶器及附件；d.脉冲电泳仪
WD-2101A 脉冲场凝胶电泳主要指标
1、凝胶板尺寸（L×W）：140mm×125mm；120mm×165mm两种规格；
2、试样格(齿数×齿宽×厚度)：14×6mm×1mm，14×6mm×2mm ；14×8.5mm×1mm，14×8.5×2mm；18×6mm×1mm，18×6mm×2mm
3、外型尺寸：（L×W×H）43cm×41cm×2cm；
4、缓冲液总容积2000ml；
5、正常工作条件为：环境温度0℃～40℃；相对湿度≤80%；周围无强烈振动；实验台应平整。
WD-2101A 脉冲场凝胶电泳使用条件
l 工作电源：交流220V 50Hz±10%
l 环境温度：10-30℃
l 环境湿度：＜80%
l 输入功率：
1.脉冲电泳仪电源：350VA
2.制冷器： 400W
连续工作时间：72h