美国华瑞PGM-1600部分环保科研工作疲于应对当前的环境管理工作需求，缺乏对环境问题的适度超前预判研究，有时甚至处于被动应对局面。在环境基础理论和基础工作方面，对大气复合污染、地下水污染、土壤重金属污染、电子废物污染、放射性废物污染、环境污染健康影响，以及重大工程引发的环境问题等新型和复杂环境问题的成因、机理和机制研究不足，科技引领有待进一步加强。
二是环保科研整体统筹协调不足。
环保科研顶层设计不足，部分科研项目立项、实施和管理存在条块分割、交叉重复现象，缺乏有效的沟通协调机制。英思科MX4一些研究项目在立项过程中对国家环保形势、环保政策分析不够，对国家环保科技需求定位不准，科技支撑能力有待进一步加强。
三是环保科技创新能力仍然薄弱。
环保系统科研队伍规模小，环保科技领军人才不足，地方环保科研能力十分薄弱。国家环境保护重点实验室和工程技术中心布局尚不完善，建设与运行资金缺乏保障，环境保护科学观测研究站建设刚刚起步。环保领域技术创新能力不足，环境管理需要的科技创新能力有待进一步加强。
四是环保科技体制机制亟待深化改革。
科技投入中竞争性投入比例过大，缺乏对公益性科研机构长期稳定支持，不利于科研工作的系统性和延续性开展。MX6环保科技创新成果转化为实际应用不畅，对环境管理的支撑作用不明显，对环保产业的带动能力不强。人才培养和激励机制有待进一步完善。国家环境保护重点实验室和工程技术中心尚需建立有效的评估和退出机制。
